Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
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1700042G07RikB1AUF7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
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1700042G07RikB1AUF7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
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1700042G07RikB1AUF7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
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1700042G07RikB1AUF7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
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1700042G07RikB1AUF7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
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1700042G07RikB1AUF7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
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1700042G07RikB1AUF7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
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1700042G07RikB1AUF7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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1700042G07RikB1AUF7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
1700042G07RikB1AUF7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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1700042G07RikB1AUF7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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1700042G07RikB1AUF7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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1700042G07RikB1AUF7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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1700042G07RikB1AUF7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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1700042G07RikB1AUF7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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