Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6880A3KG45 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6880A3KG45 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms