Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SetxA2AKX3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms