Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Frmpd1A2AKB4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Frmpd1A2AKB4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Frmpd1A2AKB4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms