Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prdm12A2AJ77 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms