Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39aA2ACP1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc39aA2ACP1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms