Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nlrp1bA1Z198 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms