Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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