Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mbd1Q9Z2E2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd1Q9Z2E2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mbd1Q9Z2E2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mbd1Q9Z2E2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mbd1Q9Z2E2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd1Q9Z2E2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd1Q9Z2E2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd1Q9Z2E2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd1Q9Z2E2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd1Q9Z2E2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd1Q9Z2E2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd1Q9Z2E2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd1Q9Z2E2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd1Q9Z2E2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd1Q9Z2E2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mbd1Q9Z2E2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mbd1Q9Z2E2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms