Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lgr5Q9Z1P4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lgr5Q9Z1P4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Lgr5Q9Z1P4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lgr5Q9Z1P4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lgr5Q9Z1P4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lgr5Q9Z1P4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lgr5Q9Z1P4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lgr5Q9Z1P4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lgr5Q9Z1P4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lgr5Q9Z1P4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lgr5Q9Z1P4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lgr5Q9Z1P4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lgr5Q9Z1P4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lgr5Q9Z1P4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lgr5Q9Z1P4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lgr5Q9Z1P4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Lgr5Q9Z1P4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lgr5Q9Z1P4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lgr5Q9Z1P4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lgr5Q9Z1P4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lgr5Q9Z1P4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lgr5Q9Z1P4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lgr5Q9Z1P4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lgr5Q9Z1P4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lgr5Q9Z1P4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lgr5Q9Z1P4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lgr5Q9Z1P4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lgr5Q9Z1P4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lgr5Q9Z1P4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lgr5Q9Z1P4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Lgr5Q9Z1P4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lgr5Q9Z1P4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lgr5Q9Z1P4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lgr5Q9Z1P4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lgr5Q9Z1P4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lgr5Q9Z1P4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lgr5Q9Z1P4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lgr5Q9Z1P4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lgr5Q9Z1P4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lgr5Q9Z1P4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lgr5Q9Z1P4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lgr5Q9Z1P4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lgr5Q9Z1P4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lgr5Q9Z1P4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lgr5Q9Z1P4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lgr5Q9Z1P4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lgr5Q9Z1P4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms