Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nek4Q9Z1J2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nek4Q9Z1J2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nek4Q9Z1J2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nek4Q9Z1J2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nek4Q9Z1J2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nek4Q9Z1J2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nek4Q9Z1J2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nek4Q9Z1J2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nek4Q9Z1J2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nek4Q9Z1J2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nek4Q9Z1J2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nek4Q9Z1J2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nek4Q9Z1J2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nek4Q9Z1J2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nek4Q9Z1J2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nek4Q9Z1J2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nek4Q9Z1J2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nek4Q9Z1J2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nek4Q9Z1J2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nek4Q9Z1J2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Nek4Q9Z1J2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nek4Q9Z1J2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nek4Q9Z1J2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nek4Q9Z1J2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nek4Q9Z1J2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nek4Q9Z1J2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nek4Q9Z1J2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nek4Q9Z1J2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nek4Q9Z1J2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nek4Q9Z1J2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nek4Q9Z1J2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nek4Q9Z1J2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nek4Q9Z1J2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nek4Q9Z1J2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nek4Q9Z1J2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nek4Q9Z1J2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nek4Q9Z1J2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Nek4Q9Z1J2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nek4Q9Z1J2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nek4Q9Z1J2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nek4Q9Z1J2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nek4Q9Z1J2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nek4Q9Z1J2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nek4Q9Z1J2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nek4Q9Z1J2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nek4Q9Z1J2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nek4Q9Z1J2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nek4Q9Z1J2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nek4Q9Z1J2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nek4Q9Z1J2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nek4Q9Z1J2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nek4Q9Z1J2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nek4Q9Z1J2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nek4Q9Z1J2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nek4Q9Z1J2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nek4Q9Z1J2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nek4Q9Z1J2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nek4Q9Z1J2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nek4Q9Z1J2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nek4Q9Z1J2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nek4Q9Z1J2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nek4Q9Z1J2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nek4Q9Z1J2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nek4Q9Z1J2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nek4Q9Z1J2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nek4Q9Z1J2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nek4Q9Z1J2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Nek4Q9Z1J2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nek4Q9Z1J2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nek4Q9Z1J2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nek4Q9Z1J2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nek4Q9Z1J2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nek4Q9Z1J2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nek4Q9Z1J2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nek4Q9Z1J2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nek4Q9Z1J2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Nek4Q9Z1J2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nek4Q9Z1J2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nek4Q9Z1J2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms