Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rspo1Q9Z132 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rspo1Q9Z132 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rspo1Q9Z132 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rspo1Q9Z132 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rspo1Q9Z132 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rspo1Q9Z132 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rspo1Q9Z132 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rspo1Q9Z132 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rspo1Q9Z132 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rspo1Q9Z132 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rspo1Q9Z132 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rspo1Q9Z132 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms