Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PapolbQ9WVP6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PapolbQ9WVP6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PapolbQ9WVP6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PapolbQ9WVP6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms