Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG9

Msl3, Male-specific lethal 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3Q9WVG9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Msl3Q9WVG9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Msl3Q9WVG9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Msl3Q9WVG9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Msl3Q9WVG9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Msl3Q9WVG9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Msl3Q9WVG9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Msl3Q9WVG9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Msl3Q9WVG9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Msl3Q9WVG9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Msl3Q9WVG9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Msl3Q9WVG9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msl3Q9WVG9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Msl3Q9WVG9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msl3Q9WVG9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msl3Q9WVG9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Msl3Q9WVG9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Msl3Q9WVG9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Msl3Q9WVG9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms