Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apobec2Q9WV35 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apobec2Q9WV35 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apobec2Q9WV35 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apobec2Q9WV35 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apobec2Q9WV35 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apobec2Q9WV35 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apobec2Q9WV35 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apobec2Q9WV35 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apobec2Q9WV35 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apobec2Q9WV35 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apobec2Q9WV35 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apobec2Q9WV35 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apobec2Q9WV35 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec2Q9WV35 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apobec2Q9WV35 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apobec2Q9WV35 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apobec2Q9WV35 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apobec2Q9WV35 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apobec2Q9WV35 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apobec2Q9WV35 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apobec2Q9WV35 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apobec2Q9WV35 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apobec2Q9WV35 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms