Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Skp1Q9WTX5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Skp1Q9WTX5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skp1Q9WTX5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Skp1Q9WTX5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms