Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vax2Q9WTP9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vax2Q9WTP9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vax2Q9WTP9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vax2Q9WTP9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms