Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Nfe2l3Q9WTM4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nfe2l3Q9WTM4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nfe2l3Q9WTM4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nfe2l3Q9WTM4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nfe2l3Q9WTM4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nfe2l3Q9WTM4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nfe2l3Q9WTM4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Nfe2l3Q9WTM4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Nfe2l3Q9WTM4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Nfe2l3Q9WTM4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nfe2l3Q9WTM4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nfe2l3Q9WTM4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nfe2l3Q9WTM4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nfe2l3Q9WTM4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nfe2l3Q9WTM4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nfe2l3Q9WTM4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nfe2l3Q9WTM4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nfe2l3Q9WTM4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nfe2l3Q9WTM4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nfe2l3Q9WTM4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nfe2l3Q9WTM4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nfe2l3Q9WTM4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Nfe2l3Q9WTM4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nfe2l3Q9WTM4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nfe2l3Q9WTM4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nfe2l3Q9WTM4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nfe2l3Q9WTM4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Nfe2l3Q9WTM4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nfe2l3Q9WTM4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nfe2l3Q9WTM4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nfe2l3Q9WTM4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Nfe2l3Q9WTM4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nfe2l3Q9WTM4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nfe2l3Q9WTM4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nfe2l3Q9WTM4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nfe2l3Q9WTM4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nfe2l3Q9WTM4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nfe2l3Q9WTM4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nfe2l3Q9WTM4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nfe2l3Q9WTM4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nfe2l3Q9WTM4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Nfe2l3Q9WTM4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nfe2l3Q9WTM4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Nfe2l3Q9WTM4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nfe2l3Q9WTM4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nfe2l3Q9WTM4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nfe2l3Q9WTM4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nfe2l3Q9WTM4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nfe2l3Q9WTM4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nfe2l3Q9WTM4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nfe2l3Q9WTM4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nfe2l3Q9WTM4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nfe2l3Q9WTM4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nfe2l3Q9WTM4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nfe2l3Q9WTM4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms