Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf4Q9QZS2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf4Q9QZS2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf4Q9QZS2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf4Q9QZS2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf4Q9QZS2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf4Q9QZS2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms