Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Abcb11Q9QY30 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Abcb11Q9QY30 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Abcb11Q9QY30 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcb11Q9QY30 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcb11Q9QY30 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcb11Q9QY30 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcb11Q9QY30 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Abcb11Q9QY30 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Abcb11Q9QY30 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcb11Q9QY30 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Abcb11Q9QY30 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcb11Q9QY30 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcb11Q9QY30 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcb11Q9QY30 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Abcb11Q9QY30 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcb11Q9QY30 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcb11Q9QY30 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Abcb11Q9QY30 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcb11Q9QY30 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Abcb11Q9QY30 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Abcb11Q9QY30 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcb11Q9QY30 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcb11Q9QY30 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Abcb11Q9QY30 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcb11Q9QY30 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcb11Q9QY30 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcb11Q9QY30 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcb11Q9QY30 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcb11Q9QY30 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms