Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ChmQ9QXG2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ChmQ9QXG2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChmQ9QXG2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ChmQ9QXG2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ChmQ9QXG2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ChmQ9QXG2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ChmQ9QXG2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChmQ9QXG2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChmQ9QXG2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChmQ9QXG2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChmQ9QXG2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChmQ9QXG2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChmQ9QXG2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChmQ9QXG2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChmQ9QXG2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChmQ9QXG2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChmQ9QXG2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChmQ9QXG2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChmQ9QXG2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChmQ9QXG2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms