Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dnaja4Q9JMC3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dnaja4Q9JMC3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dnaja4Q9JMC3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Dnaja4Q9JMC3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Dnaja4Q9JMC3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dnaja4Q9JMC3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dnaja4Q9JMC3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dnaja4Q9JMC3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dnaja4Q9JMC3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dnaja4Q9JMC3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dnaja4Q9JMC3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dnaja4Q9JMC3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dnaja4Q9JMC3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dnaja4Q9JMC3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dnaja4Q9JMC3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dnaja4Q9JMC3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Dnaja4Q9JMC3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dnaja4Q9JMC3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms