Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cabp1Q9JLK7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Cabp1Q9JLK7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Cabp1Q9JLK7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cabp1Q9JLK7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Cabp1Q9JLK7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cabp1Q9JLK7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cabp1Q9JLK7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cabp1Q9JLK7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cabp1Q9JLK7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cabp1Q9JLK7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Cabp1Q9JLK7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Cabp1Q9JLK7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cabp1Q9JLK7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Cabp1Q9JLK7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cabp1Q9JLK7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cabp1Q9JLK7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cabp1Q9JLK7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cabp1Q9JLK7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cabp1Q9JLK7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Cabp1Q9JLK7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cabp1Q9JLK7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cabp1Q9JLK7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cabp1Q9JLK7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cabp1Q9JLK7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cabp1Q9JLK7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cabp1Q9JLK7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cabp1Q9JLK7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cabp1Q9JLK7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cabp1Q9JLK7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cabp1Q9JLK7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cabp1Q9JLK7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cabp1Q9JLK7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cabp1Q9JLK7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cabp1Q9JLK7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cabp1Q9JLK7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cabp1Q9JLK7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cabp1Q9JLK7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cabp1Q9JLK7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Cabp1Q9JLK7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cabp1Q9JLK7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cabp1Q9JLK7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cabp1Q9JLK7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cabp1Q9JLK7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cabp1Q9JLK7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cabp1Q9JLK7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cabp1Q9JLK7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cabp1Q9JLK7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cabp1Q9JLK7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cabp1Q9JLK7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms