Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34,93■■■■□ 3,18
Cabp1Q9JLK7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Cabp1Q9JLK7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34,91■■■■□ 3,18
Cabp1Q9JLK7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Cabp1Q9JLK7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Cabp1Q9JLK7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Cabp1Q9JLK7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34,89■■■■□ 3,18
Cabp1Q9JLK7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Cabp1Q9JLK7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Cabp1Q9JLK7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34,89■■■■□ 3,18
Cabp1Q9JLK7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34,87■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34,86■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,86■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34,86■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,85■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34,85■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34,84■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,84■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Cabp1Q9JLK7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
Cabp1Q9JLK7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34,82■■■■□ 3,16
Cabp1Q9JLK7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,8■■■■□ 3,16
Cabp1Q9JLK7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34,8■■■■□ 3,16
Cabp1Q9JLK7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34,8■■■■□ 3,16
Cabp1Q9JLK7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Cabp1Q9JLK7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Cabp1Q9JLK7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34,79■■■■□ 3,16
Cabp1Q9JLK7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Cabp1Q9JLK7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Cabp1Q9JLK7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34,76■■■■□ 3,16
Cabp1Q9JLK7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,16
Cabp1Q9JLK7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34,76■■■■□ 3,16
Cabp1Q9JLK7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,15
Cabp1Q9JLK7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Cabp1Q9JLK7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Cabp1Q9JLK7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Cabp1Q9JLK7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Cabp1Q9JLK7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Cabp1Q9JLK7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Cabp1Q9JLK7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Cabp1Q9JLK7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Cabp1Q9JLK7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,72■■■■□ 3,15
Cabp1Q9JLK7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Cabp1Q9JLK7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Cabp1Q9JLK7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Cabp1Q9JLK7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Cabp1Q9JLK7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Cabp1Q9JLK7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34,69■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34,69■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34,69■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34,68■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34,68■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34,67■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,67■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34,66■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34,65■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34,65■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34,64■■■■□ 3,14
Cabp1Q9JLK7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Cabp1Q9JLK7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Cabp1Q9JLK7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Cabp1Q9JLK7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Cabp1Q9JLK7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Cabp1Q9JLK7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34,62■■■■□ 3,13
Cabp1Q9JLK7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Cabp1Q9JLK7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34,62■■■■□ 3,13
Cabp1Q9JLK7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34,61■■■■□ 3,13
Cabp1Q9JLK7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Cabp1Q9JLK7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Cabp1Q9JLK7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Cabp1Q9JLK7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,59■■■■□ 3,13
Cabp1Q9JLK7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Cabp1Q9JLK7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Cabp1Q9JLK7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34,57■■■■□ 3,12
Cabp1Q9JLK7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Cabp1Q9JLK7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Cabp1Q9JLK7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Cabp1Q9JLK7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34,55■■■■□ 3,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms