Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmod4Q9JLH8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmod4Q9JLH8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmod4Q9JLH8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmod4Q9JLH8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmod4Q9JLH8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmod4Q9JLH8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tmod4Q9JLH8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tmod4Q9JLH8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tmod4Q9JLH8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmod4Q9JLH8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmod4Q9JLH8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmod4Q9JLH8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmod4Q9JLH8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmod4Q9JLH8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmod4Q9JLH8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmod4Q9JLH8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmod4Q9JLH8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmod4Q9JLH8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmod4Q9JLH8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmod4Q9JLH8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmod4Q9JLH8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmod4Q9JLH8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmod4Q9JLH8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmod4Q9JLH8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmod4Q9JLH8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmod4Q9JLH8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmod4Q9JLH8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmod4Q9JLH8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmod4Q9JLH8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmod4Q9JLH8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmod4Q9JLH8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmod4Q9JLH8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmod4Q9JLH8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmod4Q9JLH8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmod4Q9JLH8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmod4Q9JLH8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmod4Q9JLH8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmod4Q9JLH8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms