Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rcan3Q9JKK0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rcan3Q9JKK0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rcan3Q9JKK0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rcan3Q9JKK0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rcan3Q9JKK0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rcan3Q9JKK0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rcan3Q9JKK0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rcan3Q9JKK0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rcan3Q9JKK0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rcan3Q9JKK0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rcan3Q9JKK0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rcan3Q9JKK0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rcan3Q9JKK0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rcan3Q9JKK0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rcan3Q9JKK0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rcan3Q9JKK0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rcan3Q9JKK0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rcan3Q9JKK0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rcan3Q9JKK0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rcan3Q9JKK0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rcan3Q9JKK0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rcan3Q9JKK0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rcan3Q9JKK0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rcan3Q9JKK0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rcan3Q9JKK0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rcan3Q9JKK0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rcan3Q9JKK0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rcan3Q9JKK0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rcan3Q9JKK0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rcan3Q9JKK0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rcan3Q9JKK0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rcan3Q9JKK0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rcan3Q9JKK0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rcan3Q9JKK0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rcan3Q9JKK0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rcan3Q9JKK0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rcan3Q9JKK0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rcan3Q9JKK0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rcan3Q9JKK0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rcan3Q9JKK0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rcan3Q9JKK0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rcan3Q9JKK0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rcan3Q9JKK0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rcan3Q9JKK0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rcan3Q9JKK0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rcan3Q9JKK0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rcan3Q9JKK0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rcan3Q9JKK0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rcan3Q9JKK0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rcan3Q9JKK0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rcan3Q9JKK0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rcan3Q9JKK0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rcan3Q9JKK0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rcan3Q9JKK0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms