Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn12Q9ET43 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn12Q9ET43 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn12Q9ET43 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn12Q9ET43 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn12Q9ET43 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms