Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES82

Popdc2, Popeye domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Popdc2Q9ES82 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Popdc2Q9ES82 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Popdc2Q9ES82 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Popdc2Q9ES82 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Popdc2Q9ES82 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Popdc2Q9ES82 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Popdc2Q9ES82 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Popdc2Q9ES82 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Popdc2Q9ES82 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Popdc2Q9ES82 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Popdc2Q9ES82 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Popdc2Q9ES82 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Popdc2Q9ES82 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Popdc2Q9ES82 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Popdc2Q9ES82 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Popdc2Q9ES82 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Popdc2Q9ES82 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Popdc2Q9ES82 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Popdc2Q9ES82 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Popdc2Q9ES82 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Popdc2Q9ES82 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Popdc2Q9ES82 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Popdc2Q9ES82 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Popdc2Q9ES82 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Popdc2Q9ES82 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Popdc2Q9ES82 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Popdc2Q9ES82 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Popdc2Q9ES82 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Popdc2Q9ES82 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Popdc2Q9ES82 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Popdc2Q9ES82 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Popdc2Q9ES82 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Popdc2Q9ES82 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Popdc2Q9ES82 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Popdc2Q9ES82 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Popdc2Q9ES82 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Popdc2Q9ES82 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Popdc2Q9ES82 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Popdc2Q9ES82 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Popdc2Q9ES82 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Popdc2Q9ES82 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Popdc2Q9ES82 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Popdc2Q9ES82 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Popdc2Q9ES82 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Popdc2Q9ES82 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Popdc2Q9ES82 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Popdc2Q9ES82 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Popdc2Q9ES82 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Popdc2Q9ES82 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Popdc2Q9ES82 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Popdc2Q9ES82 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Popdc2Q9ES82 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Popdc2Q9ES82 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Popdc2Q9ES82 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Popdc2Q9ES82 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Popdc2Q9ES82 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Popdc2Q9ES82 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Popdc2Q9ES82 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Popdc2Q9ES82 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms