Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhox9Q9EQM5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhox9Q9EQM5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhox9Q9EQM5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhox9Q9EQM5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhox9Q9EQM5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhox9Q9EQM5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox9Q9EQM5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox9Q9EQM5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox9Q9EQM5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox9Q9EQM5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox9Q9EQM5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhox9Q9EQM5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhox9Q9EQM5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhox9Q9EQM5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhox9Q9EQM5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox9Q9EQM5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rhox9Q9EQM5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhox9Q9EQM5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox9Q9EQM5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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