Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR4

Apbb2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 2, mousemouse

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Length 760 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb2Q9DBR4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apbb2Q9DBR4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Apbb2Q9DBR4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apbb2Q9DBR4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apbb2Q9DBR4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms