Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smg9Q9DB90 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smg9Q9DB90 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smg9Q9DB90 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smg9Q9DB90 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smg9Q9DB90 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg9Q9DB90 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smg9Q9DB90 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg9Q9DB90 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smg9Q9DB90 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg9Q9DB90 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg9Q9DB90 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg9Q9DB90 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg9Q9DB90 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg9Q9DB90 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg9Q9DB90 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg9Q9DB90 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg9Q9DB90 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg9Q9DB90 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smg9Q9DB90 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg9Q9DB90 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg9Q9DB90 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg9Q9DB90 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg9Q9DB90 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg9Q9DB90 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg9Q9DB90 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg9Q9DB90 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg9Q9DB90 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg9Q9DB90 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg9Q9DB90 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg9Q9DB90 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg9Q9DB90 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg9Q9DB90 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg9Q9DB90 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smg9Q9DB90 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smg9Q9DB90 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg9Q9DB90 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms