Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rsph3bQ9DA80 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsph3bQ9DA80 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsph3bQ9DA80 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rsph3bQ9DA80 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsph3bQ9DA80 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsph3bQ9DA80 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rsph3bQ9DA80 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rsph3bQ9DA80 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rsph3bQ9DA80 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rsph3bQ9DA80 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Rsph3bQ9DA80 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Rsph3bQ9DA80 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rsph3bQ9DA80 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rsph3bQ9DA80 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rsph3bQ9DA80 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rsph3bQ9DA80 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rsph3bQ9DA80 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rsph3bQ9DA80 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rsph3bQ9DA80 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rsph3bQ9DA80 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rsph3bQ9DA80 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rsph3bQ9DA80 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rsph3bQ9DA80 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rsph3bQ9DA80 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rsph3bQ9DA80 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms