Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smco2Q9DA21 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Smco2Q9DA21 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smco2Q9DA21 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smco2Q9DA21 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smco2Q9DA21 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smco2Q9DA21 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smco2Q9DA21 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smco2Q9DA21 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smco2Q9DA21 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smco2Q9DA21 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smco2Q9DA21 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smco2Q9DA21 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smco2Q9DA21 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smco2Q9DA21 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smco2Q9DA21 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smco2Q9DA21 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms