Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Q9D9S1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Q9D9S1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Q9D9S1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Q9D9S1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Q9D9S1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Q9D9S1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Q9D9S1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Q9D9S1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q9D9S1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Q9D9S1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q9D9S1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Q9D9S1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Q9D9S1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Q9D9S1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Q9D9S1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Q9D9S1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q9D9S1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q9D9S1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q9D9S1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q9D9S1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Q9D9S1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q9D9S1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q9D9S1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q9D9S1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q9D9S1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q9D9S1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q9D9S1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q9D9S1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q9D9S1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q9D9S1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Q9D9S1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Q9D9S1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q9D9S1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9D9S1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9D9S1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9D9S1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9D9S1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q9D9S1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9D9S1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q9D9S1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9D9S1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q9D9S1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Q9D9S1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q9D9S1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q9D9S1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9D9S1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9D9S1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9D9S1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9D9S1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q9D9S1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q9D9S1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q9D9S1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9D9S1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9D9S1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9D9S1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9D9S1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q9D9S1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q9D9S1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q9D9S1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q9D9S1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q9D9S1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q9D9S1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q9D9S1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q9D9S1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q9D9S1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q9D9S1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q9D9S1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q9D9S1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Q9D9S1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q9D9S1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Q9D9S1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q9D9S1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q9D9S1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q9D9S1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q9D9S1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q9D9S1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q9D9S1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q9D9S1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Q9D9S1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Q9D9S1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.4 ms