Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Capns2Q9D7J7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Capns2Q9D7J7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Capns2Q9D7J7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Capns2Q9D7J7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Capns2Q9D7J7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Capns2Q9D7J7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Capns2Q9D7J7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Capns2Q9D7J7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Capns2Q9D7J7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Capns2Q9D7J7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capns2Q9D7J7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capns2Q9D7J7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capns2Q9D7J7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capns2Q9D7J7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Capns2Q9D7J7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Capns2Q9D7J7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Capns2Q9D7J7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Capns2Q9D7J7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Capns2Q9D7J7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Capns2Q9D7J7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Capns2Q9D7J7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Capns2Q9D7J7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Capns2Q9D7J7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Capns2Q9D7J7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Capns2Q9D7J7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Capns2Q9D7J7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Capns2Q9D7J7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capns2Q9D7J7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capns2Q9D7J7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capns2Q9D7J7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Capns2Q9D7J7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capns2Q9D7J7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Capns2Q9D7J7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capns2Q9D7J7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capns2Q9D7J7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capns2Q9D7J7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capns2Q9D7J7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capns2Q9D7J7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capns2Q9D7J7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
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