Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec23bQ9D662 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec23bQ9D662 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23bQ9D662 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec23bQ9D662 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23bQ9D662 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23bQ9D662 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec23bQ9D662 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23bQ9D662 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23bQ9D662 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23bQ9D662 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23bQ9D662 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23bQ9D662 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec23bQ9D662 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23bQ9D662 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23bQ9D662 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23bQ9D662 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec23bQ9D662 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23bQ9D662 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sec23bQ9D662 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sec23bQ9D662 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sec23bQ9D662 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23bQ9D662 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23bQ9D662 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23bQ9D662 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23bQ9D662 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23bQ9D662 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23bQ9D662 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23bQ9D662 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23bQ9D662 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23bQ9D662 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23bQ9D662 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23bQ9D662 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec23bQ9D662 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms