Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sf3a3Q9D554 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sf3a3Q9D554 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3a3Q9D554 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sf3a3Q9D554 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sf3a3Q9D554 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms