Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrameQ9D4Z5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrameQ9D4Z5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrameQ9D4Z5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrameQ9D4Z5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrameQ9D4Z5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrameQ9D4Z5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrameQ9D4Z5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrameQ9D4Z5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrameQ9D4Z5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrameQ9D4Z5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrameQ9D4Z5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PrameQ9D4Z5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PrameQ9D4Z5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PrameQ9D4Z5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrameQ9D4Z5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrameQ9D4Z5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrameQ9D4Z5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrameQ9D4Z5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrameQ9D4Z5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrameQ9D4Z5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrameQ9D4Z5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrameQ9D4Z5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrameQ9D4Z5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrameQ9D4Z5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrameQ9D4Z5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrameQ9D4Z5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrameQ9D4Z5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrameQ9D4Z5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrameQ9D4Z5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrameQ9D4Z5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrameQ9D4Z5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrameQ9D4Z5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PrameQ9D4Z5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrameQ9D4Z5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrameQ9D4Z5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrameQ9D4Z5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrameQ9D4Z5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrameQ9D4Z5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrameQ9D4Z5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrameQ9D4Z5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PrameQ9D4Z5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrameQ9D4Z5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PrameQ9D4Z5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrameQ9D4Z5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrameQ9D4Z5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrameQ9D4Z5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PrameQ9D4Z5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms