Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
4933402E13RikQ9D4D2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
4933402E13RikQ9D4D2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
4933402E13RikQ9D4D2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
4933402E13RikQ9D4D2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
4933402E13RikQ9D4D2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
4933402E13RikQ9D4D2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
4933402E13RikQ9D4D2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4933402E13RikQ9D4D2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
4933402E13RikQ9D4D2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4933402E13RikQ9D4D2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4933402E13RikQ9D4D2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
4933402E13RikQ9D4D2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
4933402E13RikQ9D4D2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
4933402E13RikQ9D4D2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
4933402E13RikQ9D4D2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
4933402E13RikQ9D4D2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
4933402E13RikQ9D4D2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
4933402E13RikQ9D4D2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
4933402E13RikQ9D4D2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
4933402E13RikQ9D4D2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
4933402E13RikQ9D4D2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
4933402E13RikQ9D4D2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
4933402E13RikQ9D4D2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
4933402E13RikQ9D4D2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
4933402E13RikQ9D4D2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
4933402E13RikQ9D4D2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
4933402E13RikQ9D4D2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
4933402E13RikQ9D4D2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
4933402E13RikQ9D4D2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
4933402E13RikQ9D4D2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
4933402E13RikQ9D4D2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
4933402E13RikQ9D4D2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
4933402E13RikQ9D4D2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
4933402E13RikQ9D4D2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
4933402E13RikQ9D4D2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4933402E13RikQ9D4D2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms