Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pramef12Q9D2F1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramef12Q9D2F1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramef12Q9D2F1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramef12Q9D2F1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pramef12Q9D2F1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pramef12Q9D2F1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pramef12Q9D2F1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pramef12Q9D2F1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pramef12Q9D2F1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pramef12Q9D2F1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pramef12Q9D2F1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pramef12Q9D2F1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramef12Q9D2F1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramef12Q9D2F1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pramef12Q9D2F1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pramef12Q9D2F1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pramef12Q9D2F1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pramef12Q9D2F1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pramef12Q9D2F1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pramef12Q9D2F1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pramef12Q9D2F1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pramef12Q9D2F1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pramef12Q9D2F1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pramef12Q9D2F1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pramef12Q9D2F1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pramef12Q9D2F1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pramef12Q9D2F1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pramef12Q9D2F1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pramef12Q9D2F1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pramef12Q9D2F1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pramef12Q9D2F1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pramef12Q9D2F1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pramef12Q9D2F1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pramef12Q9D2F1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms