Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZG3

Commd8, COMM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd8Q9CZG3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Commd8Q9CZG3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Commd8Q9CZG3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Commd8Q9CZG3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Commd8Q9CZG3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Commd8Q9CZG3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Commd8Q9CZG3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Commd8Q9CZG3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Commd8Q9CZG3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Commd8Q9CZG3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Commd8Q9CZG3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Commd8Q9CZG3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Commd8Q9CZG3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Commd8Q9CZG3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Commd8Q9CZG3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Commd8Q9CZG3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Commd8Q9CZG3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Commd8Q9CZG3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Commd8Q9CZG3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Commd8Q9CZG3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Commd8Q9CZG3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Commd8Q9CZG3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Commd8Q9CZG3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Commd8Q9CZG3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Commd8Q9CZG3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Commd8Q9CZG3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Commd8Q9CZG3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Commd8Q9CZG3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Commd8Q9CZG3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Commd8Q9CZG3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Commd8Q9CZG3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Commd8Q9CZG3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Commd8Q9CZG3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Commd8Q9CZG3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Commd8Q9CZG3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Commd8Q9CZG3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Commd8Q9CZG3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Commd8Q9CZG3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Commd8Q9CZG3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Commd8Q9CZG3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Commd8Q9CZG3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Commd8Q9CZG3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Commd8Q9CZG3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Commd8Q9CZG3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Commd8Q9CZG3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Commd8Q9CZG3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Commd8Q9CZG3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Commd8Q9CZG3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Commd8Q9CZG3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Commd8Q9CZG3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Commd8Q9CZG3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Commd8Q9CZG3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Commd8Q9CZG3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Commd8Q9CZG3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Commd8Q9CZG3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Commd8Q9CZG3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Commd8Q9CZG3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Commd8Q9CZG3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Commd8Q9CZG3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Commd8Q9CZG3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Commd8Q9CZG3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Commd8Q9CZG3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Commd8Q9CZG3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Commd8Q9CZG3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Commd8Q9CZG3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Commd8Q9CZG3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Commd8Q9CZG3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms