Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prelid3bQ9CYY7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prelid3bQ9CYY7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prelid3bQ9CYY7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prelid3bQ9CYY7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prelid3bQ9CYY7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prelid3bQ9CYY7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prelid3bQ9CYY7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prelid3bQ9CYY7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prelid3bQ9CYY7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prelid3bQ9CYY7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prelid3bQ9CYY7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prelid3bQ9CYY7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prelid3bQ9CYY7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prelid3bQ9CYY7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prelid3bQ9CYY7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prelid3bQ9CYY7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prelid3bQ9CYY7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prelid3bQ9CYY7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prelid3bQ9CYY7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prelid3bQ9CYY7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prelid3bQ9CYY7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prelid3bQ9CYY7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prelid3bQ9CYY7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prelid3bQ9CYY7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prelid3bQ9CYY7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prelid3bQ9CYY7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prelid3bQ9CYY7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prelid3bQ9CYY7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prelid3bQ9CYY7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prelid3bQ9CYY7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prelid3bQ9CYY7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prelid3bQ9CYY7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prelid3bQ9CYY7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prelid3bQ9CYY7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prelid3bQ9CYY7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms