Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndufaf1Q9CWX2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufaf1Q9CWX2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufaf1Q9CWX2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufaf1Q9CWX2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndufaf1Q9CWX2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufaf1Q9CWX2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndufaf1Q9CWX2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufaf1Q9CWX2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndufaf1Q9CWX2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufaf1Q9CWX2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufaf1Q9CWX2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufaf1Q9CWX2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndufaf1Q9CWX2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ndufaf1Q9CWX2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufaf1Q9CWX2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndufaf1Q9CWX2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufaf1Q9CWX2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndufaf1Q9CWX2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufaf1Q9CWX2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndufaf1Q9CWX2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufaf1Q9CWX2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufaf1Q9CWX2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufaf1Q9CWX2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndufaf1Q9CWX2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufaf1Q9CWX2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufaf1Q9CWX2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufaf1Q9CWX2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndufaf1Q9CWX2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufaf1Q9CWX2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufaf1Q9CWX2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndufaf1Q9CWX2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndufaf1Q9CWX2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms