Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cxxc1Q9CWW7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cxxc1Q9CWW7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cxxc1Q9CWW7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cxxc1Q9CWW7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cxxc1Q9CWW7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxxc1Q9CWW7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxxc1Q9CWW7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxxc1Q9CWW7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxxc1Q9CWW7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxxc1Q9CWW7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxxc1Q9CWW7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cxxc1Q9CWW7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxxc1Q9CWW7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxxc1Q9CWW7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxxc1Q9CWW7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxxc1Q9CWW7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cxxc1Q9CWW7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cxxc1Q9CWW7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cxxc1Q9CWW7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cxxc1Q9CWW7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxxc1Q9CWW7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cxxc1Q9CWW7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxxc1Q9CWW7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cxxc1Q9CWW7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cxxc1Q9CWW7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cxxc1Q9CWW7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxxc1Q9CWW7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxxc1Q9CWW7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cxxc1Q9CWW7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxxc1Q9CWW7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxxc1Q9CWW7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxxc1Q9CWW7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cxxc1Q9CWW7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxxc1Q9CWW7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxxc1Q9CWW7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxxc1Q9CWW7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cxxc1Q9CWW7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cxxc1Q9CWW7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxxc1Q9CWW7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxxc1Q9CWW7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxxc1Q9CWW7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxxc1Q9CWW7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cxxc1Q9CWW7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxxc1Q9CWW7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cxxc1Q9CWW7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cxxc1Q9CWW7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxxc1Q9CWW7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxxc1Q9CWW7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cxxc1Q9CWW7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxxc1Q9CWW7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxxc1Q9CWW7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxxc1Q9CWW7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms