Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smc3Q9CW03 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smc3Q9CW03 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smc3Q9CW03 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smc3Q9CW03 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smc3Q9CW03 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smc3Q9CW03 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smc3Q9CW03 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smc3Q9CW03 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smc3Q9CW03 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smc3Q9CW03 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smc3Q9CW03 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smc3Q9CW03 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smc3Q9CW03 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smc3Q9CW03 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smc3Q9CW03 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smc3Q9CW03 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smc3Q9CW03 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smc3Q9CW03 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smc3Q9CW03 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smc3Q9CW03 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smc3Q9CW03 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smc3Q9CW03 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smc3Q9CW03 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smc3Q9CW03 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smc3Q9CW03 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smc3Q9CW03 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smc3Q9CW03 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smc3Q9CW03 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smc3Q9CW03 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Smc3Q9CW03 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smc3Q9CW03 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Smc3Q9CW03 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms