Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prps2Q9CS42 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prps2Q9CS42 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prps2Q9CS42 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prps2Q9CS42 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prps2Q9CS42 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prps2Q9CS42 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prps2Q9CS42 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prps2Q9CS42 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prps2Q9CS42 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prps2Q9CS42 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prps2Q9CS42 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prps2Q9CS42 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prps2Q9CS42 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prps2Q9CS42 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prps2Q9CS42 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prps2Q9CS42 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prps2Q9CS42 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms