Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chchd3Q9CRB9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chchd3Q9CRB9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chchd3Q9CRB9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chchd3Q9CRB9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chchd3Q9CRB9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chchd3Q9CRB9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chchd3Q9CRB9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chchd3Q9CRB9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chchd3Q9CRB9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chchd3Q9CRB9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chchd3Q9CRB9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chchd3Q9CRB9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chchd3Q9CRB9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chchd3Q9CRB9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chchd3Q9CRB9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chchd3Q9CRB9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chchd3Q9CRB9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chchd3Q9CRB9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chchd3Q9CRB9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms