Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifitm3Q9CQW9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifitm3Q9CQW9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifitm3Q9CQW9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifitm3Q9CQW9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ifitm3Q9CQW9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifitm3Q9CQW9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifitm3Q9CQW9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifitm3Q9CQW9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifitm3Q9CQW9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifitm3Q9CQW9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ifitm3Q9CQW9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifitm3Q9CQW9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifitm3Q9CQW9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifitm3Q9CQW9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifitm3Q9CQW9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifitm3Q9CQW9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ifitm3Q9CQW9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ifitm3Q9CQW9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ifitm3Q9CQW9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ifitm3Q9CQW9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ifitm3Q9CQW9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ifitm3Q9CQW9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ifitm3Q9CQW9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ifitm3Q9CQW9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ifitm3Q9CQW9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifitm3Q9CQW9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifitm3Q9CQW9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ifitm3Q9CQW9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ifitm3Q9CQW9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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