Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab5aQ9CQD1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rab5aQ9CQD1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rab5aQ9CQD1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab5aQ9CQD1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab5aQ9CQD1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms