Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkp2Q9CQ73 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pkp2Q9CQ73 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pkp2Q9CQ73 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pkp2Q9CQ73 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pkp2Q9CQ73 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pkp2Q9CQ73 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkp2Q9CQ73 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pkp2Q9CQ73 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkp2Q9CQ73 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkp2Q9CQ73 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkp2Q9CQ73 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkp2Q9CQ73 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkp2Q9CQ73 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkp2Q9CQ73 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkp2Q9CQ73 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkp2Q9CQ73 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms