Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ11

2010109I03Rik, RIKEN cDNA 2010109I03, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109I03RikQ9CQ11 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2010109I03RikQ9CQ11 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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2010109I03RikQ9CQ11 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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2010109I03RikQ9CQ11 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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2010109I03RikQ9CQ11 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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2010109I03RikQ9CQ11 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
2010109I03RikQ9CQ11 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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2010109I03RikQ9CQ11 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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2010109I03RikQ9CQ11 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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2010109I03RikQ9CQ11 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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2010109I03RikQ9CQ11 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
2010109I03RikQ9CQ11 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms